扫描仪是一种比较精致的设备，它在工作时需要用到内部的光电转换装置，以便把模拟信号转换成数字信号，然后再送到计算机中。这个光电转换设置中的各个光学部件对位置要求是非常高的，如果我们擅自拆卸扫描仪，不小心就会改动这些光学部件的位置，从而影响扫描仪的扫描成像工作。因此大家遇到扫描仪出现故障时，不要擅自拆修，一定要送到厂家或者指定的维修站去；另外在运送扫描仪时，一定要把扫描仪背面的锁锁上，以避免改变光学配件的位置，同时要尽量避免对扫描仪的震动或者倾斜。
扫描仪在长期工作后，可能会在工作时出现一些噪音，如果噪音太大，大家应该拆开机器盖子，找一些缝纫机油滴在卫生纸上将镜组两条轨道上的油垢擦净，再将缝纫机油滴在传动齿轮组及皮带两端的轴承上(注意油量适中)，后适当调整皮带的松紧。
扫描分辨率越高得到的图像越清晰，但是考虑到如果超过输出设备的分辨率，再清晰的图像也不可能打印出来，仅仅是多占用了磁盘空间，没有实际的价值。因此选择适当的扫描分辨率就很有必要。例如，准备使用600dpi分辨率的打印机输出结果，以600dpi扫描。如果可能，在扫描后按比例缩小大幅图象。例如，以600dpi扫描一张4*4英寸的图象，在组版程序中将它减为2*2英寸，则它的分辨率就是1200dpi。
许多平板扫描仪配有放在扫描床顶端的透明片配件。为得到透明片或幻灯片的扫描，从架子和幻灯片安装架上取下图片并安装其在玻璃扫描床上，反面朝下（反面通常是毛面）。用黑色的纸张剪出面具，覆盖除稿件被设置的地方之外的整个扫描床。这将在扫描期间减少闪耀和过份暴光。同样地，扫描三维物体时，用颜色与你扫描的物体对比强烈的物体覆盖扫描仪的盖子。这将帮助你更容易用PhotoshopColorRange工具选择它。