把保函与跟单信用证相比，当事人的权利和义务基本相同，所不同的是跟单信用证要求受益人提交的单据是包括运输单据在内的商业单据，而保函要求的单据实际上是受益人出具的关于委托人违约的声明或证明。这一区别，使两者适用范围有了很大的不同，保函可适用于各种经济交易中，为契约的一方向另一方提供担保。另外，如果委托人没有违约，保函的担保人就不必为承担赔偿责任而付款。而信用证的开证行则必须先行付款。
办理时间
1、全额保证金保函，2个工作日就可以办下来，因为审批权限在经办机构。
2、差额保证金保函，需要占用保函申请人的授信额度，需要上级审批，一般需要5个银行工作日。
3、资料完整的，投标保函约2天，履约等其他风险大的保函要较长的时间，约15个工作日。
4、企业信用良好或者信用额度足够的话，一般一周内可以下来。
一般情况下，办理银行保函有以下步骤:
一、经办人应与业务部门加强沟通，随时掌握企业投标、中标、合同谈判、签约及合同执行每一个环节的情况，熟悉标书及合同中有关银行保函的条款，弄清银行保函的具体要求，必备的担保内容及保函开具及送达后，受理人或受益人应确认的文件。
二、选择保函的开具银行。 经办人要按标书或合同中规定的要求在招标人(业主)可接受的当地银行或者选择在我国的银行抑或其他国际性银行开具保函。选择保函的开具银行时，要符合标书或合同中规定的银行信誉、支付方式的要求。
如果合同中规定业主可用两种货币向承包人结算。那么，在选择担保行时，承包人应注意所选的担保行是否可用二种相应的货币开具保函。另外，经办人还应与所选定的担保行商定保函手续费的取费标准、付款方式、保函所需押金(付款准备金)的存入、抵押形式及数量、币种。
三、正式书面委托银行开具保函时，经办人须送上有关标书或合同文件，并存入必要数量的保证金或办理好有关抵押手续，由担保行根据标书或合同中有关条款正式开具保函。
四、开具保函后，投标人或承包人应及时向招标人、业主送达或通过当地银行代交保函。 保函的递交方式，主要有招标人或承包人亲自递交、邮寄、银行传递等。有的合同规定，招标人或业主为保护自身利益，只接受当地银行开出的保函。
如果委托人与当地银行没有业务往来关系，又无资金存入当地银行时，则可以先在我国或第三国的银行开具保函到当地银行，再由当地银行向招标人或业主签发保函。应注意的是，不管用何种方式递交银行保函，都应该要求招标人或业主等在收到保函后，出具收到保函的证明文件。
五、在保函有效期内，经办人要密切与担保银行的联系，随时向担保银行提供足以证明合同义务履行的文件、资料，要求逐步减少担保金额或注销担保金额。
如有的合同是一次性履行合同义务，当一次性的合同义务履行完毕后，经办人应尽快将有关文件送给担保银行，并声明拒绝招标人的任何索赔，必要时还可要求担保银行通知招标人或业主。
如有的合同是多次履行合同义务的，则每履行完其中一项义务后，经办人就应当向银行提供一次文件(提单、发票、完工证书、验收证明等)，并要求递减担保金额，以拒绝招标人对这一项义务的索赔。企业的业务部门和财务部门应密切配合共同完成这项工作，以防止或减少对外经济合同中产生的不必要纠纷和不应当承担的赔偿。
保函又称“担保”，是银行应申请人的要求向受益人开出的、保证申请人或被担保人履行与受益人签定的合同项下义务的书面承诺。
保函的种类很多，用途十分广泛，可适用于商品、劳务、技术贸易，工程项目承包、承建，物资进出口报关，向金融机构融资，大型成套设备租赁，诉讼保全，各种合同义务的履行等领域。