按时间顺序整理
年度分类法：将档案按其形成的年度进行分类，能清晰展现档案形成的时间脉络，体现不同年度工作的连续性和发展变化。例如，一个企业每年都会产生财务报表、工作总结、业务合同等档案，按年度分类后，可直观了解企业在不同年份的经营状况和业务发展情况。
阶段分类法：对于一些大型项目或长期工作，可以根据其进展阶段来整理档案。比如，一个建设项目可分为规划设计、施工建设、竣工验收等阶段，将各阶段相关的文件、图纸、报告等分别整理在一起，能完整呈现项目的全过程。
按文件间的关联分类
系列文件分类：对于具有连续性、关联性的系列文件，如会议文件，可将会议通知、议程、报告、决议等按会议的先后顺序整理成一个系列，体现会议的完整过程和决策形成的脉络。
文件组合分类：将在内容上相互补充、相互印证的文件组合在一起。例如，一份政策文件与其相关的实施细则、解释说明、执行情况报告等组合分类，能更、深入地反映政策的制定和执行情况。
考虑档案形成背景和目的
了解形成主体：明确档案是由哪个组织、部门或个人形成的，以及其主要职能和业务范围。不同的形成主体会有不同的工作重点和主题倾向，这有助于确定档案的主题和分类标准。例如，学校的档案可能会围绕教学、科研、学生管理等主题分类，而企业的档案则会侧重于生产、销售、财务等方面。
分析形成目的：思考档案形成的目的是什么，是为了记录工作过程、总结经验教训、提供决策依据，还是为了其他特定的用途。档案的形成目的往往与主题密切相关，例如，为了总结项目经验而形成的档案，可能会以项目名称或类型作为主题分类的依据。
保持一致性和灵活性
一致性：在整个档案整理过程中，要保持主题和分类标准的一致性，避免出现同一类档案在不同部分采用不同分类标准的情况。这有助于建立统一的档案管理体系，方便档案的管理和利用。
灵活性：虽然要保持一致性，但也不能过于僵化，要根据档案的实际情况和特殊需求，适当调整和灵活运用分类标准。对于一些难以准确归类的档案，可以设置 “其他” 类别作为兜底，但要尽量减少此类情况的出现，确保分类体系的科学性和合理性。